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虚拟敲除+虚拟过表达+虚拟筛药(Science首发新算法),搭配“机器学习+单细胞细胞互作+拟时序”学习会

7月29日开始,共七个晚上(线上直播)
在线报名

课程特色

  • 多技术联合筛选核心基因:依托 GEO 疾病数据集,经差异分析、WGCNA、三类机器学习联合筛选,锁定关键致病靶点基因。
  • 双向虚拟实验深挖基因功能:结合单细胞数据,运用 scTenifoldKnk 虚拟敲除搭配虚拟过表达,一敲一过双向验证基因调控作用,无需构建基因编辑模型。
  • 前沿 AI 助力靶向药物挖掘:采用 2025 年 Science 首发 DrugReflector 算法开展全库虚拟筛药,联合分子对接快速筛选靶向小分子化合物。
  • 完整发文框架通用易复现:遵循“靶点筛选 - 功能验证 - 药物筛选”标准化研究思路,模块清晰、代码成熟,多疾病方向均可直接套用复刻课题。

课程定位

课程背景:还在靠单一虚拟敲除凑数据?发文非常内卷。当下生信高分主流是三虚拟时代:“虚拟敲除+虚拟筛药(Science首发新算法)+虚拟过表达”的联合思路,搭配“机器学习+单细胞细胞互作+拟时序”这套科研套路,复刻就能快速产出,零基础也能跟着落地。

目标学员:有发文需求的生信研究人员、各科室临床医生、医学硕/博士生。

核心方法:多组学整合分析、三类机器学习联合筛选、单细胞细胞互作与拟时序、虚拟基因敲除/过表达、AI虚拟筛药。

主讲嘉宾:钱博士(北京大学,长期从事单细胞多组学方面的项目研究,发表Nature子刊等杂志几十篇)。

课程产出:掌握“靶点筛选 - 功能验证 - 药物筛选”完整发文框架,快速复刻Q1水平SCI课题。

内容安排(七个晚上,每晚19:30-22:00)

天次 模块 核心内容与实操产出
第一天 模块一:高分论文拆解
  • 文章思路解读:2026年4月新发“多组学+机器学习+单细胞+三虚拟”JCR Q1论文解读和技术路线
  • 核心概念讲解:多组学、机器学习、虚拟基因敲除/过表达、虚拟筛药中的各种概念讲解,关键技术的应用逻辑
  • 数据库使用方法:介绍多组学数据库各个数据库使用方法
第二天 模块二:R语言入门与绘图
  • 环境配置:R语言基础介绍与安装指南,RStudio集成开发环境的配置及核心功能说明
  • R包管理:从CRAN、Bioconductor、Github等不同来源安装R包的方法与常见问题处理
  • 数据处理:数据读取、存储及统计分析(如t检验、回归分析)的典型应用场景
  • 绘图实操:小提琴图,箱型图,火山图,热图,网络图,GO、KEGG富集图
第三天 模块三:数据整合与WGCNA
  • GEO数据处理:对GEO数据库多个Osteoarthritis数据库下载,合并,去批次
  • 数据差异分析:通过limma差异分析,识别OA与正常组之间的差异表达基因
  • WGCNA挖掘关键模块:构建加权基因共表达网络,挖掘与疾病强相关的关键基因模块
  • 差异共表达基因:挖掘将差异基因与共表达基因取交集,获得差异共表达的基因集
第四天 模块四:机器学习与枢纽基因
  • 机器学习筛选核心基因:使用LASSO、RF、SVM-RFE模型进行特征重要性排序,构建相关诊断模型
  • 单基因GSEA分析:使用单基因GSEA富集分析核心基因的功能
  • 免疫浸润分析:使用CIBERSORT分析疾病和对照样本中免疫浸润的差异
第五天 模块五:诊断模型交叉验证
  • 核心基因TAZ在疾病内部数据集的表达差异和诊断价值评估
  • 核心基因TAZ在疾病训练数据集的表达差异和诊断价值评估
  • 核心基因TAZ在疾病数据集的表达差异和诊断价值评估
第六天 模块六:单细胞分析验证
  • 数据处理和注释:疾病患者单细胞数据处理和注释,绘制细胞图谱
  • 细胞通讯:各个细胞之间的通讯和细胞类型之间的代谢异质性
  • 拟时序分析:TAZ基因在发育各个阶段中的表达情况
第七天 模块七:虚拟三连击与药物筛选
  • 虚拟基因敲除:利用单细胞虚拟敲除技术模拟TAZ缺失,敲除后富集分析
  • 虚拟基因过表达:利用单细胞虚拟过表达技术模拟TAZ过表达
  • 虚拟药物筛选:使用AI驱动的治疗筛查框架(DrugReflector)筛选疾病相关的药物
  • 分子对接验证:使用分子对接验证可作为靶向TAZ的潜在治疗药物

主办单位

上海玮瑜生物科技有限公司;合肥圭林科技有限公司。

培训费用

3500元/人

三人或以上团体报名:3300元/人(团报优惠)

课后提供发票,可开会务、注册、检测、分析服务等发票。

缴费方式

银行汇款

户 名:上海玮瑜信息科技有限公司

账户号:9734 0078 8010 0000 0164

开 户 行:上海浦东发展银行大华支行

公务卡/信用卡等其他付款方式请联系客服。

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苏秘书

193 5531 3321(微信同号)

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